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肾通明细胞癌的产生和第3号染色体短臂3p25上的VHL基因失活亲昵有关，其最显著的分子病理特点为VHL基因的系统突变、启动子甲基化、第3号染色体短臂（3p）缺失（占70%-90%），从而造成该基因的2条等位基因失活。 用于肾通明细胞癌的辅助诊断。 多房性囊性肾细胞癌在2016版WH0分类中改名为低度恶性潜能多房性囊性肾肿瘤，免疫组化和分子病理同肾通明细胞癌类似，大部门肿瘤存在VHL突变和3p缺失（约74%），提醒其与通明细胞癌在分子病理水平的有关性，对该肿瘤的医治推荐选取保留肾手术。